R jest podstawowym językiem programowania w bioinformatyce i statystyce, a jego znajomość kojarzona jest z prestiżem i najwyższymi kompetencjami analitycznymi. Korzystamy z R w naszej codziennej pracy i chętnie dzielimy się naszym doświadczeniem i umiejętnościami.

Na nasze warsztaty zapraszamy wszystkich, którzy chcą rozszerzyć swoje kompetencje w zakresie analizy danych. Nasi wykładowcy to praktycy R z ogromnym dorobkiem naukowym i szkoleniowym, pracujący na co dzień w obszarach big data i supercomputingu.

Nadzór nad programem szkoleń pełni Aneta Sawikowska - doktor nauk matematycznych, bioinformatyk pracujący na co dzień w obszarze big data, autorka publikacji naukowych z zakresu matematyki, analizy statystycznej, analizy poziomu ekspresji genów, analizy sieci korelacyjnych, analizy danych metabolomicznych i innych.

Organizujemy także specjalistyczne szkolenia z R dla firm i jednostek naukowo-badawczych oraz kursy indywidualne.

Wybrani klienci:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu;
Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu;
Uniwersytet Ekonomiczny w Poznaniu;
Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu;
Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego Polskiej Akademii Nauk i inni.



Aktualna oferta kursów R i warsztatów bioinformatycznych
Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących (2-dniowe warsztaty online)

Szkolenie dotyczy osób, które nigdy nie miały styczności z programowaniem w R. Zaczniemy od bardzo podstawowych zagadnień podpartych szeregiem ćwiczeń. Zapraszamy pracowników naukowych, pracowników firm sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności w posługiwaniu się językiem R.

Terminy: 4 i 5 lutego 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

Lokalizacja: warsztaty zdalne.

Grupa: do 10 osób.

Wykładowca: Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz.

Cena: 899 zł netto (1105,77 zł brutto).

Zagadnienia:

  • Wprowadzenie do R i RStudio
  • Podstawowe operatory logiczne, funkcje matematyczne, statystyczne, R jako kalkulator
  • Podstawowe typy danych: wektory, macierze, ramki danych, listy
  • Wprowadzenie do programowania: pętle, instrukcje warunkowe, funkcje
  • Wprowadzenie do analizy danych: podstawowe statystyki opisowe, testy statystyczne: test t, anova, testy sprawdzania równości wariancji, zgodności z rozkładem normalnym
  • Podstawowe wykresy: histogram, boxplot, wykresy rozrzutu, mapy ciepła, dendrogramy

  • Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących (2-dniowe warsztaty online)

    Szkolenie dotyczy osób, które nigdy nie miały styczności z programowaniem w R. Zaczniemy od bardzo podstawowych zagadnień podpartych szeregiem ćwiczeń. Zapraszamy pracowników naukowych, pracowników firm sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności w posługiwaniu się językiem R.

    Terminy: 4 i 5 lutego 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Grupa: do 10 osób.

    Wykładowca: Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz.

    Cena: 899 zł netto (1105,77 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Wprowadzenie do R i RStudio
  • Podstawowe operatory logiczne, funkcje matematyczne, statystyczne, R jako kalkulator
  • Podstawowe typy danych: wektory, macierze, ramki danych, listy
  • Wprowadzenie do programowania: pętle, instrukcje warunkowe, funkcje
  • Wprowadzenie do analizy danych: podstawowe statystyki opisowe, testy statystyczne: test t, anova, testy sprawdzania równości wariancji, zgodności z rozkładem normalnym
  • Podstawowe wykresy: histogram, boxplot, wykresy rozrzutu, mapy ciepła, dendrogramy

  • Analiza danych w R i RStudio dla średnio zaawansowanych (2-dniowe warsztaty online)

    Warsztat dla osób, które mają już pewne doświadczenie w programowaniu w R, innych językach lub ukończyły nasz warsztat "Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących". Nauczymy Cię używać języka R do przygotowania, analizy oraz interpretacji danych. Przekażemy Ci podstawowy warsztat analityka i praktyczną wiedzę z zakresu analizy danych i statystyki. Zapraszamy pracowników firm przetwarzających zbiory danych, analityków, naukowców, pracowników sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności analizowania danych w języku R.

    Terminy: 18 i 19 lutego 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 10 osób.

    Wykładowca: Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz.

    Cena: 899 zł netto (1105,77 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Krótkie wprowadzenie do R i RStudio
  • Podstawowe statystyki opisowe: miary tendencji centralnej, miary rozrzutu, analiza rozkładu danych
  • Podstawowe wykresy
  • Podstawy wizualizacji danych: pakiet ggplot2
  • Podstawowe testy statystyczne: test t dla dwóch prób, test Kruskala-Wallisa, test Friedmana, test Wilcoxona, porównania wielokrotne
  • Testy zgodności, niezależności
  • Regresja prosta, regresja wielokrotna
  • Analiza składowych głównych

  • Analiza danych w R i RStudio dla średnio zaawansowanych (2-dniowe warsztaty online)

    Warsztat dla osób, które mają już pewne doświadczenie w programowaniu w R, innych językach lub ukończyły nasz warsztat "Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących". Nauczymy Cię używać języka R do przygotowania, analizy oraz interpretacji danych. Przekażemy Ci podstawowy warsztat analityka i praktyczną wiedzę z zakresu analizy danych i statystyki. Zapraszamy pracowników firm przetwarzających zbiory danych, analityków, naukowców, pracowników sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności analizowania danych w języku R.

    Terminy: 18 i 19 lutego 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 10 osób.

    Wykładowca: Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz.

    Cena: 899 zł netto (1105,77 zł brutto)..

    Zagadnienia:

  • Krótkie wprowadzenie do R i RStudio
  • Podstawowe statystyki opisowe: miary tendencji centralnej, miary rozrzutu, analiza rozkładu danych
  • Podstawowe wykresy
  • Podstawy wizualizacji danych: pakiet ggplot2
  • Podstawowe testy statystyczne: test t dla dwóch prób, test Kruskala-Wallisa, test Friedmana, test Wilcoxona, porównania wielokrotne
  • Testy zgodności, niezależności
  • Regresja prosta, regresja wielokrotna
  • Analiza składowych głównych

  • Analiza danych RNA-seq w R (2-dniowe warsztaty online)

    Kurs rozpoczniemy od krótkiego wstępu dotyczącego podstaw R, po czym przejdziemy do przedstawienia specyfiki analiz danych wysokoprzepustowych, jakimi są dane pochodzące z eksperymentu RNA-seq. Zapoznamy Państwa z wstępną analizą takich danych tj. analizą jakości, mapowaniem oraz wstępną filtracją i normalizacją, a następnie przejdziemy do analizy wyższego rzędu czyli analizy różnicowej i ontologii genowej. Przekazujemy wiedzę praktyczną popartą przykładami, ćwiczeniami oraz tzw. case study. Kurs ma na celu wprowadzić w podstawy analiz dużych zbiorów danych next generation sequencing (NGS).

    Terminy: 5 i 6 marca 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowca: Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz.

    Cena: 1000 zł netto (1230 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Krótkie wprowadzenie do R. Pakiet dplyr
  • Podstawowe statystyki opisowe: miary tendencji centralnej, miary rozrzutu, analiza rozkładu danych
  • Podstawowe wykresy
  • Podstawy wizualizacji danych: pakiet ggplot2
  • Wprowadzenie do RNA-seq i Bioconductor
  • Analiza jakości, mapowanie, zliczanie countów
  • Testy zgodności, niezależności
  • Podstawowe testy statystyczne dla danych NGS: edgeR, deseq, limma
  • Analiza GO i KEGG
  • Wizualizacja wyników
  • Case study

  • Analiza danych RNA-seq w R (2-dniowe warsztaty online)

    Kurs rozpoczniemy od krótkiego wstępu dotyczącego podstaw R, po czym przejdziemy do przedstawienia specyfiki analiz danych wysokoprzepustowych, jakimi są dane pochodzące z eksperymentu RNA-seq. Zapoznamy Państwa z wstępną analizą takich danych tj. analizą jakości, mapowaniem oraz wstępną filtracją i normalizacją, a następnie przejdziemy do analizy wyższego rzędu czyli analizy różnicowej i ontologii genowej. Przekazujemy wiedzę praktyczną popartą przykładami, ćwiczeniami oraz tzw. case study. Kurs ma na celu wprowadzić w podstawy analiz dużych zbiorów danych next generation sequencing (NGS).

    Terminy: 5 i 6 marca 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowca: Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz.

    Cena: 1000 zł netto (1230 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Krótkie wprowadzenie do R. Pakiet dplyr.=
  • Podstawowe statystyki opisowe: miary tendencji centralnej, miary rozrzutu, analiza rozkładu danych
  • Podstawowe wykresy
  • Podstawy wizualizacji danych: pakiet ggplot2
  • Wprowadzenie do RNA-seq i Bioconductor
  • Analiza jakości, mapowanie, zliczanie countów
  • Testy zgodności, niezależności
  • Podstawowe testy statystyczne dla danych NGS: edgeR, deseq, limma
  • Analiza GO i KEGG
  • Wizualizacja wyników
  • Case study

  • Populacyjna analiza farmakokinetyki i farmakodynamiki (PK i PD) leków w badaniach klinicznych - zastosowanie programu RStudio do analizy danych i interpretacji wyników.  (2-dniowe warsztaty online)

    Specjalistyczny warsztat dla naukowców i pracowników firm farmaceutycznych zajmujących się analizą danych klinicznych.

    Terminy: 22 i 23 marca 2021 10:00-15:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowca: dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert.

    Cena: 2300 zł netto (2829 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Składowe modelu populacyjnego
  • Model stochastyczny. Cechy modelu
  • Metody analizy populacyjnej
  • Nieliniowe modelowanie efektów mieszanych. Efekty stałe i losowe
  • Zastosowanie programu RStudio w procesie budowania i ewaluacji modelu populacyjnego. Analiza regresji liniowej i wykorzystanie pakietu xpose4. Etapy budowania i ewaluacji populacyjnego modelu PKPD
  • Model zmiennych towarzyszących. Wpływ indywidualnych cech pacjenta na parametry PK i PD leku
  • Praktyczne przykłady analizy danych klinicznych w programie RStudio

  • Populacyjna analiza farmakokinetyki i farmakodynamiki (PK i PD) leków w badaniach klinicznych - zastosowanie programu RStudio do analizy danych i interpretacji wyników.  (2-dniowe warsztaty online)

    Specjalistyczny warsztat dla naukowców i pracowników firm farmaceutycznych zajmujących się analizą danych klinicznych.

    Terminy: 22 i 23 marca 2021 10:00-15:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowca: dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert.

    Cena: 2300 zł netto (2829 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Składowe modelu populacyjnego
  • Model stochastyczny. Cechy modelu
  • Metody analizy populacyjnej
  • Nieliniowe modelowanie efektów mieszanych. Efekty stałe i losowe
  • Zastosowanie programu RStudio w procesie budowania i ewaluacji modelu populacyjnego. Analiza regresji liniowej i wykorzystanie pakietu xpose4. Etapy budowania i ewaluacji populacyjnego modelu PKPD
  • Model zmiennych towarzyszących. Wpływ indywidualnych cech pacjenta na parametry PK i PD leku
  • Praktyczne przykłady analizy danych klinicznych w programie RStudio

  • Wykładowcy



    Dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert

    Kierownik Pracowni Farmakogenetyki Doświadczalnej. Adiunkt w Katedrze Farmacji Klinicznej i Biofarmacji w Poznaniu. Odbyła staż naukowy w School of Pharmaceutical Sciences na Uniwersytecie w Buffalo, kolebce farmakokinetyki i farmakodynamiki. Wysokiej klasy specjalista i praktyk R, RStudio i NONMEM, a także podstaw teoretycznych modelowania PKPD i analizy populacyjnej. Doświadczony wykładowca w przedmiotach biofarmacji, farmakoterapii z naukową informacją o lekach oraz farmakogenetyki. Ekspert w dziedzinie modelowania farmakokinetyczno-farmakodynamicznego (PKPD) leków stosowanych w anestezjologii i intensywnej terapii pacjentów dorosłych oraz dzieci.



    Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz

    Adiunkt w Katedrze Metod Matematycznych i Statystycznych na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu. Doświadczony szkoleniowiec.
 Ekspert i praktyk w dziedzinie rozwoju metod statystycznych oraz analityk danych biologicznych z 11-letnim doświadczeniem. Specjalista w dziedzinie analizy danych RNA-seq. Stypendystka programu Sciex, w ramach którego odbyła staż naukowy w FGCZ w Zurichu. Odbyła również staż zagraniczny w Williamsburgu. Współpracuje 
m. in. z Instytutem Genetyki Człowieka PAN, Politechniką Poznańską, Uniwersytetem BOKU w Wiedniu, Politechniką Federalną i Uniwersytetem 
w Zurychu.

    Wykładowcy

    Dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert

    Kierownik Pracowni Farmakogenetyki Doświadczalnej. Adiunkt w Katedrze Farmacji Klinicznej i Biofarmacji w Poznaniu. Odbyła staż naukowy w School of Pharmaceutical Sciences na Uniwersytecie w Buffalo, kolebce farmakokinetyki i farmakodynamiki. Wysokiej klasy specjalista i praktyk R, RStudio i NONMEM, a także podstaw teoretycznych modelowania PKPD i analizy populacyjnej. Doświadczony wykładowca w przedmiotach biofarmacji, farmakoterapii z naukową informacją o lekach oraz farmakogenetyki. Ekspert w dziedzinie modelowania farmakokinetyczno-farmakodynamicznego (PKPD) leków stosowanych w anestezjologii i intensywnej terapii pacjentów dorosłych oraz dzieci.



    Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz

    Adiunkt w Katedrze Metod Matematycznych i Statystycznych na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu. Doświadczony szkoleniowiec.
 Ekspert i praktyk w dziedzinie rozwoju metod statystycznych oraz analityk danych biologicznych z 11-letnim doświadczeniem. Specjalista w dziedzinie analizy danych RNA-seq. Stypendystka programu Sciex, w ramach którego odbyła staż naukowy w FGCZ w Zurichu. Odbyła również staż zagraniczny w Williamsburgu. Współpracuje 
m. in. z Instytutem Genetyki Człowieka PAN, Politechniką Poznańską, Uniwersytetem BOKU w Wiedniu, Politechniką Federalną i Uniwersytetem 
w Zurychu.