R jest podstawowym językiem programowania w bioinformatyce i statystyce, a jego znajomość kojarzona jest z prestiżem i najwyższymi kompetencjami analitycznymi. Korzystamy z R w naszej codziennej pracy i chętnie dzielimy się naszym doświadczeniem i umiejętnościami.

Na nasze warsztaty zapraszamy wszystkich, którzy chcą rozszerzyć swoje kompetencje w zakresie analizy danych. Nasi wykładowcy to praktycy R z ogromnym dorobkiem naukowym i szkoleniowym, pracujący na co dzień w obszarach big data i supercomputingu.

Nadzór nad programem szkoleń pełni Aneta Sawikowska - doktor nauk matematycznych, bioinformatyk pracujący na co dzień w obszarze big data, autorka publikacji naukowych z zakresu matematyki, analizy statystycznej, analizy poziomu ekspresji genów, analizy sieci korelacyjnych, analizy danych metabolomicznych i innych.

Organizujemy także specjalistyczne szkolenia z R dla firm i jednostek naukowo-badawczych oraz kursy indywidualne.

Wybrani klienci:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu;
Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu;
Uniwersytet Ekonomiczny w Poznaniu;
Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu;
Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego Polskiej Akademii Nauk i inni.



Aktualna oferta kursów R i warsztatów bioinformatycznych
Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących (2-dniowe warsztaty online)

Szkolenie dotyczy osób, które nigdy nie miały styczności z programowaniem w R. Zaczniemy od bardzo podstawowych zagadnień podpartych szeregiem ćwiczeń. Zapraszamy pracowników naukowych, pracowników firm sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności w posługiwaniu się językiem R. Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

Terminy: 10 i 11 września 2021, 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online); 5 i 6 listopada 2021, 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

Lokalizacja: warsztaty zdalne.

Grupa: do 10 osób.

Wykładowcy: prof. UAM dr hab. Łukasz Smaga.

Cena: 1199 zł netto (1474,77 zł brutto).

Zagadnienia:

  • Wprowadzenie do R i RStudio
  • Podstawowe operatory logiczne, funkcje matematyczne, statystyczne, R jako kalkulator
  • Podstawowe typy danych: wektory, macierze, ramki danych, listy 
  • Wprowadzenie do programowania: pętle, instrukcje warunkowe, funkcje 
  • Wprowadzenie do analizy danych: podstawowe statystyki opisowe, testy statystyczne: test t
  • Podstawy wizualizacji danych: pakiet ggplot2: wykresy słupkowe, histogram, boxploty

    • Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących (2-dniowe warsztaty online)

    Szkolenie dotyczy osób, które nigdy nie miały styczności z programowaniem w R. Zaczniemy od bardzo podstawowych zagadnień podpartych szeregiem ćwiczeń. Zapraszamy pracowników naukowych, pracowników firm sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności w posługiwaniu się językiem R.Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

    Terminy: 10 i 11 września 2021, 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online); 5 i 6 listopada 2021, 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Grupa: do 10 osób.

    Wykładowcy: prof. UAM dr hab. Łukasz Smaga.

    Cena: 1199 zł netto (1474,77 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Wprowadzenie do R i RStudio
  • Podstawowe operatory logiczne, funkcje matematyczne, statystyczne, R jako kalkulator
  • Podstawowe typy danych: wektory, macierze, ramki danych, listy 
  • Wprowadzenie do programowania: pętle, instrukcje warunkowe, funkcje 
  • Wprowadzenie do analizy danych: podstawowe statystyki opisowe, testy statystyczne: test t
  • Podstawy wizualizacji danych: pakiet ggplot2: wykresy słupkowe, histogram, boxploty

    • Statystyka w R i RStudio (2-dniowe warsztaty online)

    Warsztat dla osób, które mają już pewne doświadczenie w programowaniu w R, innych językach lub ukończyły nasz warsztat "Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących". Nauczymy Cię używać języka R do przygotowania, analizy oraz interpretacji danych. Przekażemy Ci podstawowy warsztat analityka i praktyczną wiedzę z zakresu analizy danych i statystyki. Zapraszamy pracowników firm przetwarzających zbiory danych, analityków, naukowców, pracowników sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności analizowania danych w języku R. Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

    Terminy: 25 i 26 września 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online); 13 i 14 listopada 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 10 osób.

    Wykładowcy: dr Alicja Szabelska-Beręsewicz, dr inż. Joanna Zyprych-Walczak.

    Cena: 1199 zł netto (1474,77 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Podstawowe statystyki opisowe: miary tendencji centralnej, miary rozrzutu
  • Wizualizacja danych na potrzeby statystyki
  • Podstawowe testy statystyczne: test t, anova, porównania wielokrotne, testy sprawdzania równości wariancji, zgodności z rozkładem normalnym
  • Podstawowe testy statystyczne nieparametryczne: Kruskala-Wallisa, test Friedmana, test Wilcoxona, porównania wielokrotne
  • Testy zgodności, niezależności 
  • Regresja prosta, regresja wielokrotna
  • Analiza korelacji
  • Analiza składowych głównych

    • Statystyka w R i RStudio (2-dniowe warsztaty online)

    Warsztat dla osób, które mają już pewne doświadczenie w programowaniu w R, innych językach lub ukończyły nasz warsztat "Wprowadzenie do R i RStudio dla początkujących". Nauczymy Cię używać języka R do przygotowania, analizy oraz interpretacji danych. Przekażemy Ci podstawowy warsztat analityka i praktyczną wiedzę z zakresu analizy danych i statystyki. Zapraszamy pracowników firm przetwarzających zbiory danych, analityków, naukowców, pracowników sektora bankowego i finansowego oraz wszystkich zainteresowanych nabyciem umiejętności analizowania danych w języku R. Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

    Terminy: 25 i 26 września 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online); 13 i 14 listopada 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 10 osób.

    Wykładowcy: dr Alicja Szabelska-Beręsewicz, dr inż. Joanna Zyprych-Walczak.

    Cena: 1199 zł netto (1474,77 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Podstawowe statystyki opisowe: miary tendencji centralnej, miary rozrzutu
  • Wizualizacja danych na potrzeby statystyki
  • Podstawowe testy statystyczne: test t, anova, porównania wielokrotne, testy sprawdzania równości wariancji, zgodności z rozkładem normalnym
  • Podstawowe testy statystyczne nieparametryczne: Kruskala-Wallisa, test Friedmana, test Wilcoxona, porównania wielokrotne
  • Testy zgodności, niezależności 
  • Regresja prosta, regresja wielokrotna
  • Analiza korelacji
  • Analiza składowych głównych

    • Analiza danych RNA-seq w R (2-dniowe warsztaty online)

    Kurs rozpoczniemy od krótkiego wstępu dotyczącego podstaw R, po czym przejdziemy do przedstawienia specyfiki analiz danych wysokoprzepustowych, jakimi są dane pochodzące z eksperymentu RNA-seq. Zapoznamy Państwa z kompleksową analizą transkryptomu. Składają się na nią elementy takie jak analiza jakości, mapowanie, wstępna filtracja i normalizacja, analiza wyższego rzędu czyli analiza różnicowa oraz ontologia genowa. Przekazujemy wiedzę praktyczną popartą przykładami, ćwiczeniami oraz tzw. case study. Kurs ma na celu wprowadzić w podstawy analiz dużych zbiorów danych next generation sequencing (NGS). Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

    Terminy: 9 i 10 października 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online); 20 i 21 listopada 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowcy: dr Alicja Szabelska-Beręsewicz, dr inż. Joanna Zyprych-Walczak.

    Cena: 1299 zł netto (1597,77 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Wprowadzenie do RNA-seq i Bioconductor
  • Analiza jakości sekwencjonowania
  • Mapowanie i zliczanie odczytów 
  • Wstępna obróbka danych countowych
  • Podstawowe testy statystyczne dla danych NGS: edgeR, deseq, limma
  • Analiza GO i KEGG
  • Wizualizacja wyników
  • Case study

    • Analiza danych RNA-seq w R (2-dniowe warsztaty online)

    Kurs rozpoczniemy od krótkiego wstępu dotyczącego podstaw R, po czym przejdziemy do przedstawienia specyfiki analiz danych wysokoprzepustowych, jakimi są dane pochodzące z eksperymentu RNA-seq. Zapoznamy Państwa z kompleksową analizą transkryptomu. Składają się na nią elementy takie jak analiza jakości, mapowanie, wstępna filtracja i normalizacja, analiza wyższego rzędu czyli analiza różnicowa oraz ontologia genowa. Przekazujemy wiedzę praktyczną popartą przykładami, ćwiczeniami oraz tzw. case study. Kurs ma na celu wprowadzić w podstawy analiz dużych zbiorów danych next generation sequencing (NGS). Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

    Terminy: 9 i 10 października 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online); 20 i 21 listopada 2021 9:00-14:00 (2-dniowe warsztaty online).

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowcy: dr Alicja Szabelska-Beręsewicz, dr inż. Joanna Zyprych-Walczak.

    Cena: 1299 zł netto (1597,77 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Wprowadzenie do RNA-seq i Bioconductor
  • Analiza jakości sekwencjonowania
  • Mapowanie i zliczanie odczytów 
  • Wstępna obróbka danych countowych
  • Podstawowe testy statystyczne dla danych NGS: edgeR, deseq, limma
  • Analiza GO i KEGG
  • Wizualizacja wyników
  • Case study

    • Analiza wyników badań klinicznych w RStudio (2-dniowe warsztaty online)

    Specjalistyczny warsztat dla naukowców i pracowników firm farmaceutycznych zajmujących się analizą danych klinicznych. Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

    Terminy wkrótce.

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowca: prof. dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert.

    Cena: 2300 zł netto (2829 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Składowe modelu populacyjnego
  • Model stochastyczny. Cechy modelu
  • Metody analizy populacyjnej
  • Nieliniowe modelowanie efektów mieszanych. Efekty stałe i losowe
  • Zastosowanie programu RStudio w procesie budowania i ewaluacji modelu populacyjnego. Analiza regresji liniowej i wykorzystanie pakietu xpose4. Etapy budowania i ewaluacji populacyjnego modelu PKPD
  • Model zmiennych towarzyszących. Wpływ indywidualnych cech pacjenta na parametry PK i PD leku
  • Praktyczne przykłady analizy danych klinicznych w programie RStudio

    • Analiza wyników badań klinicznych w RStudio (2-dniowe warsztaty online)

    Specjalistyczny warsztat dla naukowców i pracowników firm farmaceutycznych zajmujących się analizą danych klinicznych. Szkolenie ma charakter prowadzonego na żywo warsztatu, ze sprawdzaniem postępów uczestników i możliwością zadawania pytań.

    Terminy wkrótce.

    Liczba godzin: 10 (5 godzin każdego dnia z przerwą kawową).

    Lokalizacja: warsztaty zdalne.

    Grupa: do 7 osób.

    Wykładowca: prof. dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert.

    Cena: 2300 zł netto (2829 zł brutto).

    Zagadnienia:

  • Składowe modelu populacyjnego
  • Model stochastyczny. Cechy modelu
  • Metody analizy populacyjnej
  • Nieliniowe modelowanie efektów mieszanych. Efekty stałe i losowe
  • Zastosowanie programu RStudio w procesie budowania i ewaluacji modelu populacyjnego. Analiza regresji liniowej i wykorzystanie pakietu xpose4. Etapy budowania i ewaluacji populacyjnego modelu PKPD
  • Model zmiennych towarzyszących. Wpływ indywidualnych cech pacjenta na parametry PK i PD leku
  • Praktyczne przykłady analizy danych klinicznych w programie RStudio

    • Wykładowcy



    Prof. dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert

    Kierownik Pracowni Farmakogenetyki Doświadczalnej. Profesor w Katedrze Farmacji Klinicznej i Biofarmacji Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu. Odbyła staż naukowy w School of Pharmaceutical Sciences na Uniwersytecie w Buffalo, kolebce farmakokinetyki i farmakodynamiki. Wysokiej klasy specjalista i praktyk R, RStudio i NONMEM, a także podstaw teoretycznych modelowania PKPD i analizy populacyjnej. Doświadczony wykładowca w przedmiotach biofarmacji, farmakoterapii z naukową informacją o lekach oraz farmakogenetyki. Ekspert w dziedzinie modelowania farmakokinetyczno-farmakodynamicznego (PKPD) leków stosowanych w anestezjologii i intensywnej terapii pacjentów dorosłych oraz dzieci.



    Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz

    Adiunkt w Katedrze Metod Matematycznych i Statystycznych na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu. Doświadczony szkoleniowiec.
 Ekspert i praktyk w dziedzinie rozwoju metod statystycznych oraz analityk danych biologicznych z 11-letnim doświadczeniem. Specjalista w dziedzinie analizy danych RNA-seq. Stypendystka programu Sciex, w ramach którego odbyła staż naukowy w FGCZ w Zurichu. Odbyła również staż zagraniczny w Williamsburgu. Współpracuje 
m. in. z Instytutem Genetyki Człowieka PAN, Politechniką Poznańską, Uniwersytetem BOKU w Wiedniu, Politechniką Federalną i Uniwersytetem 
w Zurychu.



    Dr inż. Joanna Zyprych-Walczak

    Adiunkt w Katedrze Metod Matematycznych i Statystycznych na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu.
Autor podręcznika do nauki R. Doświadczony szkoleniowiec.
Ekspert i praktyk w dziedzinie analizy w R i rozwoju metod statystycznych z 12-letnim doświadczeniem. Jeden z najlepszych europejskich specjalistów w dziedzinie RNA-seq. Odbyła staże zagraniczne w Williamsburgu, Waszyngtonie i Zurychu. Współpracuje 
m. in. z Instytutem Genetyki Człowieka, Politechniką Poznańską, Uniwersytetem w Wiedniu, Politechniką Federalną i Uniwersytetem 
w Zurychu.



    Prof. UAM dr hab. Łukasz Smaga

    Profesor uczelni w Zakładzie Statystyki Matematycznej i Analizy Danych na Wydziale Matematyki i Informatyki Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Pracuje naukowo w dziedzinach testowania hipotez statystycznych, analizy danych funkcjonalnych oraz teorii eksperymentu. Zajmuje się również zastosowaniami metod statystycznych i uczenia maszynowego w praktycznych zagadnieniach. Od wielu lat programuje w języku R i jest współautorem dwóch jego pakietów dostępnych w repozytoriach CRAN i github. Doświadczony dydaktyk w zakresie rachunku prawdopodobieństwa, statystyki matematycznej i jej zastosowań. Współpracuje m.in. z pracownikami National University of Singapore, TU Dortmund University, Texas Tech University, Shiga University, Politechniki Poznańskiej i Uniwersytetu Ekonomicznego w Poznaniu.

    Wykładowcy

    Prof. dr hab. n. farm. Agnieszka Bienert

    Kierownik Pracowni Farmakogenetyki Doświadczalnej. Profesor w Katedrze Farmacji Klinicznej i Biofarmacji Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu. Odbyła staż naukowy w School of Pharmaceutical Sciences na Uniwersytecie w Buffalo, kolebce farmakokinetyki i farmakodynamiki. Wysokiej klasy specjalista i praktyk R, RStudio i NONMEM, a także podstaw teoretycznych modelowania PKPD i analizy populacyjnej. Doświadczony wykładowca w przedmiotach biofarmacji, farmakoterapii z naukową informacją o lekach oraz farmakogenetyki. Ekspert w dziedzinie modelowania farmakokinetyczno-farmakodynamicznego (PKPD) leków stosowanych w anestezjologii i intensywnej terapii pacjentów dorosłych oraz dzieci.



    Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz

    Adiunkt w Katedrze Metod Matematycznych i Statystycznych na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu. Doświadczony szkoleniowiec.
 Ekspert i praktyk w dziedzinie rozwoju metod statystycznych oraz analityk danych biologicznych z 11-letnim doświadczeniem. Specjalista w dziedzinie analizy danych RNA-seq. Stypendystka programu Sciex, w ramach którego odbyła staż naukowy w FGCZ w Zurichu. Odbyła również staż zagraniczny w Williamsburgu. Współpracuje 
m. in. z Instytutem Genetyki Człowieka PAN, Politechniką Poznańską, Uniwersytetem BOKU w Wiedniu, Politechniką Federalną i Uniwersytetem 
w Zurychu.



    Dr inż. Joanna Zyprych-Walczak

    Adiunkt w Katedrze Metod Matematycznych i Statystycznych na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu.
Autor podręcznika do nauki R. Doświadczony szkoleniowiec.
Ekspert i praktyk w dziedzinie analizy w R i rozwoju metod statystycznych z 12-letnim doświadczeniem. Jeden z najlepszych europejskich specjalistów w dziedzinie RNA-seq. Odbyła staże zagraniczne w Williamsburgu, Waszyngtonie i Zurychu. Współpracuje 
m. in. z Instytutem Genetyki Człowieka, Politechniką Poznańską, Uniwersytetem w Wiedniu, Politechniką Federalną i Uniwersytetem 
w Zurychu.



    Prof. UAM dr hab. Łukasz Smaga

    Profesor uczelni w Zakładzie Statystyki Matematycznej i Analizy Danych na Wydziale Matematyki i Informatyki Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Pracuje naukowo w dziedzinach testowania hipotez statystycznych, analizy danych funkcjonalnych oraz teorii eksperymentu. Zajmuje się również zastosowaniami metod statystycznych i uczenia maszynowego w praktycznych zagadnieniach. Od wielu lat programuje w języku R i jest współautorem dwóch jego pakietów dostępnych w repozytoriach CRAN i github. Doświadczony dydaktyk w zakresie rachunku prawdopodobieństwa, statystyki matematycznej i jej zastosowań. Współpracuje m.in. z pracownikami National University of Singapore, TU Dortmund University, Texas Tech University, Shiga University, Politechniki Poznańskiej i Uniwersytetu Ekonomicznego w Poznaniu.